Evaluering av RAZOR™-instrument for identifisering av biologiske trusselstoffer

FFI-Rapport 2013

Om publikasjonen

Rapportnummer

2013/01195

ISBN

978-82-464-2263-3

Format

PDF-dokument

Størrelse

5.2 MB

Språk

Norsk

Last ned publikasjonen
Ingjerd Thrane Mari Espelund Tone Aarskaug Janet Martha Blatny
Ved en biologisk hendelse er det viktig å undersøke tilstedeværelse av biologiske trusselstoffer så raskt som mulig og identifisere dem, samt å avklare om de biologiske trusselstoffene utgjør en reell trussel. PCRteknikken er en spesifikk og rask molekylærbiologisk metode for å påvise genomet til mikroorganismer, og den er mye brukt for å identifisere biologiske trusselstoffer. For bruk av PCR-metoden i felt er det utviklet kommersielt tilgjengelige PCR-instrumenter som er robuste og brukervennlige. Slike feltinstrumenter kan bidra til å foreløpig identifisere ett eller flere biologiske trusselstoffer og dermed å avklare situasjonen og være av betydning for den videre håndteringen av hendelsen. FFI har testet og evaluert to PCR-systemer for bruk i felt fra leverandøren BioFire Diagnostics, Inc. (Salt Lake City, UT, USA); RAZORTM og RAZORTM EX BioDetection System. Arbeidet har vært knyttet til FFI-prosjektene ”Evaluering av biologisk trussel II” og ”Biologisk deteksjon og identifikasjon”. RAZORTM- instrumentet benytter brukerens egne PCR-reagenser som tilsettes tomme reagenskassetter tilhørende instrumentet. FFI testet RAZORTM-systemets sensitivitet ved analyse av DNA fra bakteriene Bacillus anthracis (miltbrann), Brucella maris (brucellose), Francisella tularensis (harepest), Salmonella enterica (salmonellose), Yersinia pestis (pest), Burkholderia mallei (snive) og Shigella flexneri (diaré), samt fra Bacillus atrophaeus- sporer (simulant for B. anthracis sporer). Sensitiviteten ble målt til 10-10000 genomkopier/mL for de ulike mikroorganismene. Den oppnådde sensitiviteten viste seg å være tilsvarende eller 10 ganger bedre/svakere enn de oppgitte verdiene fra produsenten. RAZORTM EX-systemet ble testet med det tilhørende”The 10® Target Screen Kit” som inneholder en reagenskassett med frysetørkede reagenser og primere for testing av DNA fra ti ulike biologiske trusselstoffer i en og samme analysetest: Bacillus anthracis (miltbrann), Brucella melitensis (brucellose), Clostridium botulinum type A (botulisme), Coxiella burnetii (Q feber), Escherichia coli O157 (diaré), Francisella tularensis (harepest), Ricinus communis (ricinforgiftning), Salmonella enterica (salmonellose), Variola virus (kopper) og Yersinia pestis (pest). FFI testet RAZORTM EX-systemet for DNA fra B. anthracis, C. botulinum type A, E. coli O157, F. tularensis, ricin, S. enterica og Y. pestis. Resultatene viste at RAZORTM EX-systemet kunne påvise DNA fra blandinger av de testede biologiske trusselstoffene. Det ble testet og påvist opp til seks trusselstoffer samtidig. RAZORTM EX-systemet ble også testet for sin evne til å påvise B. atrophaeus (simulant for B. anthracis), S. enterica, E. coli O157, C. botulinum type A og B. anthracis enten i form av bakterieceller, sporer eller DNA i komplekse prøver som inneholdt bakterieartene enten hver for seg eller i en blanding. De utvalgte komplekse prøvematerialene var melk, hvetemel og jord. Resultatene viste at alle de testede biologiske trusselstoffene, med unntak av C. botulinum type A-sporer, kunne identifiseres i de komplekse prøvene uten en krevende forbehandling av prøvematerialet. Selv om sporeformen av C. botulinum ikke ble identifisert i testen, er det sannsynlig at celler i aktiv vekst ville blitt påvist. RAZORTM EX-systemet er et lett, bærbart og meget brukervennlig instrument for analyse av også komplekse prøver for innhold av biologiske trusselstoffer. Instrumentet kan benyttes i felt av ikkespesialister og utrenede brukere, samt på et laboratorium, da god sensitivitet oppnås. Det tar kun 30 minutter å teste tilstedeværelse av de ti trusselstoffene med bruk av ”The 10® Target Screen Kit”. Dette tidsestimatet inkluderer forarbeid med preparering av prøvene til analysen. Bruk av interne kontroller i kit’et kvalitetssikrer resultatet fra RAZORTM EX-analysesystemet. RAZORTM EX vurderes som meget velegnet for ikke-spesialister fra både sivile og militære aktører. Instrumentet kan benyttes når det er ønskelig med en rask analyse for å oppnå en foreløpig identifisering av biologiske trusselstoffer enten i felt eller på et mobilt laboratorium.

Nylig publisert